截至2019年6月，南通市有65個鎮(zhèn)。

65個鎮(zhèn)分別為：川姜鎮(zhèn)、五接鎮(zhèn)、張芝山鎮(zhèn)、石港鎮(zhèn)、西亭鎮(zhèn)、二甲鎮(zhèn)、東社鎮(zhèn)、三余鎮(zhèn)、十總鎮(zhèn)、興仁鎮(zhèn)、劉橋鎮(zhèn)、平潮鎮(zhèn)、城東鎮(zhèn)、角斜鎮(zhèn)、海安鎮(zhèn)、李堡鎮(zhèn)、大公鎮(zhèn)、曲塘鎮(zhèn)、南莫鎮(zhèn)、白甸鎮(zhèn)、墩頭鎮(zhèn)、雅周鎮(zhèn)、長江鎮(zhèn)、石莊鎮(zhèn)、搬經(jīng)鎮(zhèn)、丁堰鎮(zhèn)、下原鎮(zhèn)、磨頭鎮(zhèn)、吳窯鎮(zhèn)、白蒲鎮(zhèn)、江安鎮(zhèn)、九華鎮(zhèn)、長沙鎮(zhèn)、洋口鎮(zhèn)、大豫鎮(zhèn)、栟茶鎮(zhèn)、雙甸鎮(zhèn)、新店鎮(zhèn)、馬塘鎮(zhèn)、豐利鎮(zhèn)、曹埠鎮(zhèn)、岔河鎮(zhèn)、河口鎮(zhèn)、袁莊鎮(zhèn)、三星鎮(zhèn)、臨江鎮(zhèn)、包場鎮(zhèn)、常樂鎮(zhèn)、余東鎮(zhèn)、正余鎮(zhèn)、悅來鎮(zhèn)、四甲鎮(zhèn)、海永鎮(zhèn)、呂四港鎮(zhèn)、匯龍鎮(zhèn)、北新鎮(zhèn)、惠萍鎮(zhèn)、王鮑鎮(zhèn)、寅陽鎮(zhèn)、東海鎮(zhèn)、近海鎮(zhèn)、南陽鎮(zhèn)、海復(fù)鎮(zhèn)、合作鎮(zhèn)、啟隆鎮(zhèn)南通市區(qū)有崇川區(qū)、港閘區(qū)、通州區(qū)和富民港辦事處（與南通經(jīng)濟技術(shù)開發(fā)區(qū)管委會合署辦公），下轄海安市（2018年撤縣建市）、如東縣、啟東市、如皋市、海門市。有鎮(zhèn)65個、街道37個，村民委員會1304個、居民委員會619個，場圃5個。其中，崇川區(qū)有街道12個，港閘區(qū)有街道6個，富民港辦事處有街道2個，通州區(qū)有鎮(zhèn)12個、街道4個，海安市有鎮(zhèn)9個、街道4個，如東縣有鎮(zhèn)12個、街道3個，啟東市有鎮(zhèn)12個，如皋市有鎮(zhèn)11個、街道3個，海門市有鎮(zhèn)9個、街道3個。