京都百大學(xué)除了宇治校區(qū)(理科一些研究機(jī)構(gòu)設(shè)在這里)位于離校本部15公里外的宇治市外,其它的幾個(gè)校區(qū)基本連在一起,從北到南的4個(gè)校區(qū)是:北校度園,包含部分研究所、中心、理學(xué)部、農(nóng)知學(xué)部等機(jī)構(gòu);西校園,本部校區(qū)、人文科學(xué)各學(xué)部、工學(xué)部、以及學(xué)校行政機(jī)構(gòu);南校園,包含道教養(yǎng)學(xué)部、醫(yī)學(xué)部以及它們的內(nèi)研究設(shè)施、藥學(xué)部和醫(yī)院。
另外,新建成的桂校區(qū),位于京都市的西部,主要作為大部分工學(xué)研究生的教育基地,目前局容部還在建設(shè)中。