日本原來與大陸相連，大約在洪積世晚期至沖擊世初期，日本各地發(fā)生海進(jìn)，出現(xiàn)了日本海。

距今約1萬年前，成為今天的日本列島。日本人類在舊石器時(shí)代尾期才較大發(fā)展，在舊石器時(shí)代大部分時(shí)間（約十萬年前）發(fā)展緩慢，考古研究發(fā)現(xiàn)，在幾十萬年前來自中國北方的原始人類進(jìn)入朝鮮半島上居住，其中少量人（大概十萬年前）才開始又遷徙到日本。日本最早的人類化石是在十萬年前，迄今日本舊石器時(shí)代的遺址發(fā)展近一千處，但有人骨化石出土的不滿十處，化石主要有明石人、葛生人、牛川人、三日人等?？脊艑W(xué)和人類學(xué)觀點(diǎn)認(rèn)為日本民族是主要由東北亞游牧民族，阿爾泰語系的人、古代中原人、長江下游的吳越人、微量馬來人以及微量中南半島的印支人混合而來，逐漸遷移到日本混合衍變而來。也有學(xué)者認(rèn)為是更新世中國華南的蒙古人種東擴(kuò)到達(dá)日本。此外還有“單一人種說”、“人種更替說”、“混血說”、“變形說”等說法。自從中國戰(zhàn)國后期，大量燕國人、齊國人、楚國人和越國人等為躲避戰(zhàn)亂逃到朝鮮半島和日本，以后到清朝時(shí)，在中國北方出現(xiàn)戰(zhàn)亂和災(zāi)害時(shí)，陸續(xù)中國人移民朝鮮半島，后來又從這里向東向南到了日本或直接到日本列島。