元培學(xué)院是北大本科的一個院系，它可以在本科第二年任意選擇北大內(nèi)的任何一個專業(yè)，并得到相應(yīng)的畢業(yè)證書。

元培學(xué)院的前身是北大的“元培實驗班”和“元培計劃”，它是北大眾多院系之一，只招收本科生。在北大，是分數(shù)最高的幾個院系之一，招收的狀元人數(shù)也是基本上僅次于光華管理學(xué)院的。而北京物理學(xué)院是北京大學(xué)的二級學(xué)院。北京大學(xué)1913年設(shè)立物理學(xué)門，我國物理學(xué)本科教育從此開始。

1919年更名為物理系?？箲?zhàn)時期，北大、清華、南開三校物理系合并于西南聯(lián)合大學(xué)。

1952年全國院系調(diào)整后，北京大學(xué)物理系集原北大、清華、燕大三校物理精英成為我國高校實力最強的物理重鎮(zhèn)，并先后創(chuàng)辦或參與創(chuàng)建全國高校第一個核科學(xué)專業(yè)、半導(dǎo)體物理專業(yè)、地球物理專業(yè)、微電子專業(yè)等。

2001年，北京大學(xué)物理學(xué)院在原物理系以及重離子物理研究所、技術(shù)物理系核物理專業(yè)、地球物理系大氣物理與氣象專業(yè)、天文系的基礎(chǔ)上組建成立。他們都屬于北大的二級學(xué)院。這就是他們的區(qū)別。