有邯鄲路校區(qū),江灣校區(qū),楓林校區(qū),張江校區(qū)四個校區(qū)。
1937年抗日戰(zhàn)爭,復(fù)旦部分師生在吳南軒校長帶領(lǐng)下,輾轉(zhuǎn)內(nèi)遷重慶北碚(渝校)。
1941年增設(shè)了農(nóng)學(xué)院。經(jīng)國民政府行政院批準(zhǔn),1942年元旦復(fù)旦由私立改為國立,全稱為國立復(fù)旦大學(xué),吳南軒,章益先后出任校長。
1946年渝校遷回上海江灣原址,與滬校合并,學(xué)校的規(guī)模進(jìn)一步擴(kuò)大。