中科院（中國科學(xué)院）與清華大學(xué)北大（北京大學(xué)）的區(qū)別主要表現(xiàn)在以下幾個方面：

1. 成立與定位：中科院是中國最高的自然科學(xué)研究機構(gòu)，成立于1949年，致力于開展基礎(chǔ)研究和戰(zhàn)略科技研究；清華大學(xué)和北京大學(xué)則是中國兩所最頂尖的綜合性大學(xué)之一，清華大學(xué)以工工為主，北京大學(xué)以文理為主。

2. 層次與規(guī)模：中科院包括二處中科院所和數(shù)量眾多的科研院所，涵蓋了多個學(xué)科領(lǐng)域，其下屬機構(gòu)數(shù)量龐大，并在國內(nèi)外享有較高聲譽；清華大學(xué)和北京大學(xué)則是中國規(guī)模最大、層次最高的綜合性大學(xué)之一，兩校的學(xué)科涵蓋面廣，并在國內(nèi)外都擁有較高的學(xué)術(shù)地位和聲譽。

3. 辦學(xué)層次：中科院下設(shè)研究生院，主要培養(yǎng)研究生和博士生；清華大學(xué)和北京大學(xué)則是綜合性大學(xué)，除研究生之外還招收本科生，并提供本科教育。

4. 教育與科研重心：中科院的主要任務(wù)是開展科學(xué)研究，為國家決策提供科技支持，培養(yǎng)高水平科研人才；清華大學(xué)和北京大學(xué)不僅注重科學(xué)研究，也重視教育和人才培養(yǎng)，其本科教育和研究生教育在國內(nèi)外都享有較高聲譽?？偟膩碚f，中科院是中國最高的科研機構(gòu)，以研究為主導(dǎo)，清華大學(xué)和北京大學(xué)則是綜合性大學(xué)，注重教育和科研，并且在多個學(xué)科領(lǐng)域都有卓越的表現(xiàn)。