中國南海研究院位于海口市江東新區(qū)，是以南海為專門研究對象并從事相關(guān)學(xué)術(shù)交流的專業(yè)學(xué)術(shù)研究機構(gòu)。

其前身是創(chuàng)立于1996年的“海南南海研究中心”。

2004年7月，經(jīng)國務(wù)院批準(zhǔn)，“海南南海研究中心”正式更名為“中國南海研究院”，由此邁入新的發(fā)展階段。為進一步拓展南海研究事業(yè)，加強和完善學(xué)術(shù)網(wǎng)絡(luò)建設(shè)，2013年1月研究院成立“中國南海研究院北京分院”。

2016年3月，“中國-東南亞南海研究中心”正式成立，是第一家在我國境內(nèi)設(shè)立的以南海為研究對象的國際合作研究機構(gòu)。

2017年6月，研究院與武漢大學(xué)中國邊界與海洋研究院被納入國家高端智庫培育名單。