1. 學位分類區(qū)別：工學碩士為學術(shù)型研究生，工程碩士為工程類專業(yè)學位。

2. 生源方面的區(qū)別：工學碩士以應(yīng)屆畢業(yè)生為主，多數(shù)沒有實踐經(jīng)驗；工程碩士以具有工程實踐經(jīng)驗的優(yōu)秀在職人員為主。

3. 培養(yǎng)側(cè)重點的區(qū)別：工學碩士研究生教育以研究和發(fā)現(xiàn)自然界客觀規(guī)律為主，強調(diào)理論學習和學術(shù)研究；工程碩士專業(yè)學位研究生教育側(cè)重于工程應(yīng)用。