中山大學(xué)和南京理工大學(xué)相比，肯定是中山大學(xué)層次高。

中山大學(xué)位于廣州市，是一所實力很強的綜合性大學(xué)，九八五和二一一雙料大學(xué)。南京理工大學(xué)位于南京市，是國防七子之一，二一一工程大學(xué)，兵器科學(xué)是王牌專業(yè)，機械、計算機等工科專業(yè)在全國也有一定地位，雖然說實力很強，但比起中山大學(xué)，還是有較大差距。