學校有國家重點學科1個；博士學位一級學科授權(quán)點3個；碩士學位一級學科授權(quán)點3個，碩士專業(yè)學位授權(quán)類別1個；博士后科研流動站2個，上海市重點學科2個，上海市高峰學科、高原學科3個。

上海音樂學院是全國最早建立碩士、博士、博士后流動站的完整教學科研體系的音樂院校，是全國唯一一所擁有“音樂與舞蹈學”“藝術(shù)學理論”“戲劇與影視學”三個一級學科博士點的專業(yè)音樂學院，形成了音樂創(chuàng)作、音樂表演、音樂理論、音樂應(yīng)用“四輪驅(qū)動”的音樂學科綜合體系