食用菌是高等真菌中可食種類(lèi)的總稱(chēng)，是一類(lèi)具有大型肉質(zhì)或膠質(zhì)的子實(shí)體的可食真菌（edible fungi），分別屬于真菌界的子囊菌門(mén)和擔(dān)子菌門(mén)。

約有95%的食用菌是擔(dān)子菌，少數(shù)屬于子囊菌（如羊肚菌、塊菌、蟲(chóng)草等）。據(jù)統(tǒng)計(jì)，目前全世界已記載的食用菌超過(guò)2000種。我國(guó)的食用菌資源十分豐富，種類(lèi)繁多，已知1200多種，已栽培100多種（卯曉嵐，2008）。包括食用菌在內(nèi)的真菌屬于多細(xì)胞真核生物。多細(xì)胞真核生物包括三個(gè)界，它們是光合自養(yǎng)的植物界、攝食營(yíng)養(yǎng)的動(dòng)物界和以吸收方式獲取營(yíng)養(yǎng)的真菌界。食用菌通稱(chēng)蘑菇，中國(guó)古代把生長(zhǎng)在木上的蘑菇稱(chēng)作“菌”，而把土中生長(zhǎng)的稱(chēng)作“蕈”。由于“蕈”在漢語(yǔ)里有泛指能產(chǎn)生子實(shí)體的大型真菌之義，故現(xiàn)在也常將蘑菇稱(chēng)為“蕈菌”。日文漢字中則用“菌蕈”作為蘑菇的同義詞。