京都大學(xué)是繼東京大學(xué)之后成立的日本第二所國(guó)立大學(xué)。1892年，23位國(guó)會(huì)議員在向國(guó)會(huì)提出的一個(gè)議案中提出，日本僅有一所東京國(guó)立大學(xué)，缺乏競(jìng)爭(zhēng)，對(duì)辦學(xué)和學(xué)生的培養(yǎng)都不利，建議在當(dāng)時(shí)的西京-京都建一所大學(xué)，1897年議案被通過(guò)，大學(xué)得以誕生，當(dāng)時(shí)定名為京都帝國(guó)大學(xué)。初建時(shí)整個(gè)大學(xué)只有一個(gè)理工科分科大學(xué)，共有6個(gè)專(zhuān)業(yè)21個(gè)講座，學(xué)生不到500人，木下廣次為首任校長(zhǎng)。數(shù)年之后，又增設(shè)了法科、醫(yī)科、文科等3所分科大學(xué)，這時(shí)全校已有5個(gè)分科大學(xué)。4年后新的大學(xué)令頒布，分科大學(xué)改名為學(xué)部。法學(xué)部原有的法律學(xué)和經(jīng)濟(jì)學(xué)分家，同時(shí)上升為學(xué)部。經(jīng)過(guò)數(shù)年的努力，農(nóng)學(xué)部和一些研究機(jī)構(gòu)相繼成立，學(xué)校規(guī)模有了很大的發(fā)展，學(xué)生人數(shù)成倍增加，京都第三高中并入后，以此為基礎(chǔ)成立了人文學(xué)部，后發(fā)展成為今天的教養(yǎng)學(xué)部。戰(zhàn)后，按照新的教育法，全部實(shí)行新制，削去帝國(guó)大學(xué)中的“帝國(guó)”二字，清除軍國(guó)主義對(duì)京都大學(xué)的破壞和影響，包括實(shí)行男女共學(xué)，清理教師隊(duì)伍，廢除一些不合時(shí)宜的講座，增設(shè)教育學(xué)部、藥學(xué)部和一些研究所，研究生的教育得到了長(zhǎng)足發(fā)展，對(duì)外開(kāi)放門(mén)戶(hù)。這樣，京都大學(xué)就成了在日本僅次于東京大學(xué)的學(xué)科齊全、規(guī)模宏大的國(guó)立綜合大學(xué)。