吉林大學(xué)在東北亞研究方面具有較長的歷史。

早在1964年，經(jīng)國家教育部批準(zhǔn)就成立了日本問題研究室和朝鮮問題研究室。20世紀(jì)80年代初，又先后成立了日本研究所、人口研究所、蘇聯(lián)研究所、朝鮮研究所四個(gè)研究機(jī)構(gòu)。為適應(yīng)世界經(jīng)濟(jì)區(qū)域化和集團(tuán)化發(fā)展形勢的需要，特別是為東北亞地區(qū)國際合作提供理論支持，將原有的以國別研究為主的研究力量組織起來，形成綜合研究優(yōu)勢，1988年吉林大學(xué)成立了東北亞研究中心，并于1992年又增設(shè)了圖們江國際開發(fā)研究所和綜合研究所。從此，吉林大學(xué)在東北亞問題的研究上實(shí)現(xiàn)了從以往以國別問題為主，向由東北亞研究中心牽頭、實(shí)行各所松散聯(lián)合開展綜合研究的轉(zhuǎn)變。1994年4月，吉林大學(xué)在原東北亞研究中心的基礎(chǔ)上，將日本研究所、人口研究所、俄羅斯研究所、朝鮮韓國研究所、圖們江國際開發(fā)研究所、綜合研究所六個(gè)處級建制的研究機(jī)構(gòu)合并，成立了東北亞研究院，從而實(shí)現(xiàn)了由過去獨(dú)立機(jī)構(gòu)松散聯(lián)合到以研究院為實(shí)體緊密結(jié)合的研究組織體系的轉(zhuǎn)變。1997年，由吉林大學(xué)東北亞研究院牽頭的"東北亞區(qū)域經(jīng)濟(jì)、歷史與社會(huì)發(fā)展"學(xué)科，被國家批準(zhǔn)為"211工程"重點(diǎn)學(xué)科建設(shè)項(xiàng)目。為了進(jìn)一步改革科研體制，適應(yīng)深化東北亞問題研究的需要，2001年9月，東北亞研究院將已有的4個(gè)以國別研究為主的研究所和綜合研究所，進(jìn)行按學(xué)科專業(yè)整合，形成了東北亞研究院下設(shè)經(jīng)濟(jì)研究所，政治研究所，歷史與文化研究所，人口、資源與環(huán)境研究所和圖們江國際開發(fā)研究所5個(gè)研究所的新組織結(jié)構(gòu)格局。2003年5月，為適應(yīng)東北亞研究院被批準(zhǔn)招收區(qū)域經(jīng)濟(jì)學(xué)專業(yè)博士研究生和加強(qiáng)區(qū)域經(jīng)濟(jì)學(xué)學(xué)科建設(shè)的需要，從經(jīng)濟(jì)研究所和人口、資源與環(huán)境研究所抽調(diào)部分研究力量，重新成立了區(qū)域經(jīng)濟(jì)研究所。