兩所學校實力差別不很大，新疆大學綜合實力更強些。

新疆大學工科更好點，石河子的農林和經濟方面更強些。我覺得你可以根據自己希望報考的專業(yè)去選擇學校，選擇你報考專業(yè)實力更強、氛圍和底蘊更好的學校。石河子大學優(yōu)勢學科：農業(yè)工程、作物學、園藝學、畜牧學、農林經濟管理國家重點學科（1個）：作物栽培學與耕作學。國家重點學科培育點（1個）：農業(yè)經濟管理。自治區(qū)級重點學科（13個）：作物栽培學與耕作學、應用化學、化學工程與技術、作物學、植物保護、農業(yè)機械化工程、農業(yè)水土工程、畜牧學、園藝學、病理學與病理生理學、預防獸醫(yī)學、農業(yè)經濟管理、生物化學與分子生物學。作物栽培、農業(yè)經濟管理、農業(yè)機械化、園藝園林等都值得推薦------------------------------新疆大學優(yōu)勢學科：理論經濟學，馬克思主義理論，中國語言文學，數學，化學，地理學，生物學，機械工程，電氣工程，計算機科學與技術，化學工程與技術。機械、電氣、計算機、經濟學都是很不錯的專業(yè)和行業(yè)，錢景好