南通大學(xué)分四個(gè)校區(qū):啟秀校區(qū)、鐘秀校區(qū)、文峰校區(qū)、嗇園校區(qū)。

嗇園校區(qū)：文學(xué)院、理學(xué)院、、商學(xué)院、外國語學(xué)院、化學(xué)化工學(xué)院、機(jī)械工程學(xué)院、電子信息學(xué)院、電氣工程學(xué)院、計(jì)算機(jī)科學(xué)與技術(shù)學(xué)院、建筑工程學(xué)院、紡織服裝學(xué)院、地理科學(xué)學(xué)院；鐘秀校區(qū)：教育科學(xué)學(xué)院、生命科學(xué)學(xué)院、體育科學(xué)學(xué)院、地理科學(xué)學(xué)院、藝術(shù)學(xué)院、杏林學(xué)院；文峰校區(qū)：公共衛(wèi)生學(xué)院、地理科學(xué)學(xué)院、理學(xué)院、法政與管理學(xué)院；啟秀校區(qū)：護(hù)理學(xué)院、醫(yī)學(xué)院。南通大學(xué)設(shè)有20個(gè)學(xué)院、1個(gè)獨(dú)立學(xué)院（杏林學(xué)院）、1家直屬大型綜合三級(jí)甲等醫(yī)院（南通大學(xué)附屬醫(yī)院）和國際教育學(xué)院、繼續(xù)教育學(xué)院。擁有基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、臨床醫(yī)學(xué)、信息與通信工程3個(gè)博士后流動(dòng)站，基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、臨床醫(yī)學(xué)、信息與通信工程3個(gè)一級(jí)學(xué)科博士點(diǎn)。