東京理科大學有五個校區(qū)，分別是神樂坂校區(qū)、葛飾校區(qū)、野田校區(qū)、久喜校區(qū)和長萬部校區(qū)。

神樂坂校區(qū)和葛飾校區(qū)位于東京都，是理學部第一部、理學部第二部、工學部第一部、工學部第一部和理學專攻科所在地；野田校區(qū)位于千葉縣，那里有藥學部、理工學部和基礎(chǔ)工學部二年級以上的學生；久喜校區(qū)位于琦玉縣，經(jīng)營學部設(shè)在這里；長萬部校區(qū)位于北海道，基礎(chǔ)工業(yè)學部一年級的學生在這里學習。