讀碩士論文時，電子檔做筆記有以下幾種方法：

1. 高亮和下劃線：大多數(shù)電子書閱讀器都有高亮和下劃線的功能，你可以通過這些功能來標(biāo)記重要的信息。

2. 添加注釋：你可以在電子書中添加注釋，記錄你的想法和問題。

3. 制作書簽：你可以為重要的頁面制作書簽，方便以后查閱。

4. 使用電子筆記軟件：有一些電子筆記軟件可以與電子書閱讀器同步，你可以在這些軟件中做筆記，例如Evernote、OneNote等。

5. 截圖：如果你需要保存一段特別重要的文字，你可以選擇截圖保存。

6. 制作思維導(dǎo)圖：如果你的論文內(nèi)容比較復(fù)雜，你可以嘗試用思維導(dǎo)圖的方式來整理你的筆記。7. 使用專門的文獻(xiàn)管理軟件：如EndNote、Mendeley等，這些軟件可以幫助你管理和整理你的參考文獻(xiàn)，同時也可以做筆記。記住，做筆記的目的是幫助你理解和記憶論文的內(nèi)容，所以你應(yīng)該選擇最適合你的方法。