長崎擁有多所高等教育機構(gòu)，其中包括著名的大學(xué)，如下所述：

長崎大學(xué)（Nagasaki University）

類型：國立大學(xué)

成立時間：1949年

地址：長崎縣長崎市

特點：日本一流研究型國立大學(xué)之一，醫(yī)學(xué)部是舊制六大醫(yī)科大學(xué)之一。

歷史：由長崎醫(yī)科大學(xué)等多所學(xué)府合并而成，是日本歷史最悠久的公立醫(yī)學(xué)校之一。

排名：在2024年QS世界大學(xué)排名中位于第801-850位，日本排名第20位。

長崎外國語大學(xué)（Nagasaki University of Foreign Studies）

類型：私立大學(xué)

成立時間：1945年

地址：長崎縣長崎市

特點：日本全國僅有的8所以外國語大學(xué)命名的大學(xué)之一。

學(xué)生構(gòu)成：留學(xué)生占30%，其中中國人占留學(xué)生的60-80%。

長崎綜合科學(xué)大學(xué)（Nagasaki Institute of Applied Science）

類型：私立大學(xué)

成立時間：1942年

地址：長崎縣長崎市

特點：理工科專業(yè)排名全國第33位，私立大學(xué)中排名第8位。

教育：提供別科、學(xué)部（本科）、碩士、博士等課程。

長崎縣立大學(xué)（Nagasaki Prefectural University）

類型：公立大學(xué)

成立時間：1901年

地址：長崎縣長崎市

特點：擁有超過百年歷史的日本公立大學(xué)，信息媒體學(xué)和營養(yǎng)看護學(xué)專業(yè)就業(yè)率高。