中國(guó)大運(yùn)河博物館的展覽將全流域、全時(shí)段、全方位展覽中國(guó)大運(yùn)河的歷史和文化。

展覽的總體定位是“運(yùn)河帶來(lái)的美好生活”，共設(shè)有“大運(yùn)河——中國(guó)的世界文化遺產(chǎn)”“因運(yùn)而生——大運(yùn)河沿岸的傳統(tǒng)生活”“大運(yùn)河兩岸非物質(zhì)文化遺產(chǎn)”“世界知名運(yùn)河與運(yùn)河城市”“中國(guó)大運(yùn)河藝術(shù)史詩(shī)”“紫禁城與大運(yùn)河”“隋煬帝與大運(yùn)河”“運(yùn)河與自然展”“運(yùn)河上的舟楫”“流動(dòng)的文化——中國(guó)大運(yùn)河”“探索大運(yùn)河：青少年互動(dòng)體驗(yàn)展”等11個(gè)專題展。