首先，你既然有入臺證，那么入臺肯定是沒問題的了，用入臺證和入臺證上面寫的證件（你的上面應(yīng)該是寫護(hù)照號吧）入臺就可以了。

其次，在澳門值機(jī)的時(shí)候一樣也是用入臺證和護(hù)照就可以了，這是沒問題的。

最后，就是上海到澳門段，如果你有港澳通行證，那么自然就沒問題的?？墒侨绻銢]港澳通行證的話，我不確定上海海關(guān)會不會放你出境。理由如下：

1、你懂的，為什么會有獨(dú)立的港澳通行證、臺灣通行證，為什么不統(tǒng)一用護(hù)照就好，就是面子問題，護(hù)照用于出國，而那些地方是要被稱為中國的，所以只能搞出很多的證件來。所以，你沒港澳通行證去澳門的話，很多情況下是不會放你出境大陸的。
2、如果你有大通證，去澳門轉(zhuǎn)機(jī)飛臺灣，那么OK的，大陸海關(guān)是會讓你出境的，但是你說了你沒有大通證。
3、如果你有第三國簽證（或者去雙免簽國家）和澳門飛第三國的機(jī)票，那么你也可以用護(hù)照出境大陸。但問題你是澳門飛臺灣，在這里護(hù)照就不管用了啊，原因就是第一點(diǎn)提到的。

所以結(jié)論就是，你問一下出上海飛澳門段的航空公司，是否能給你值機(jī)辦理登機(jī)牌，如果它們說OK的可以的，那么你到時(shí)候拿了登機(jī)牌后，走自助通道用護(hù)照出境去候機(jī)廳，因?yàn)槲腋杏X如果走人工通道的話，也許會被刁難，海關(guān)邊檢人員業(yè)務(wù)能力相差很大，有些根本就什么都不懂，我之前在浦東就遇到過一次不給我出境的。